宏基因組測序

宏基因組測序是一種利用高通量測序技術完成微生物群落所有物種基因組的檢測和功能分析的方法。宏基因組測序技術無需微生物的分離純化培養,能夠快速有效地獲得整個微生物群落的基因信息,可以更加深入地對群落結構、物種分類、系統進化、基因功能及代謝網絡等方面進行研究。

應用領域
1、群落微生物物種分類
2、群落功能分析
3、未知物種鑒定

技術路線

分析內容
標準信息分析
1. 測序質量評估與數據過濾
2. 過濾宿主數據(若有宿主)
3. 宏基因組組裝
4. 組裝結果統計與評估
5. 物種注釋及物種豐度統計
6. 基因預測
7. 基因豐度分析
8. 基因功能注釋(KEGG, eggNOG, CAZy數據庫)
9. 基因功能豐度分析及聚類熱圖
10. 多樣品間比較分析(分別在物種和功能水平上的PCA分析和聚類分析)

定制化信息分析
可結合客戶的需求,協商確定其他定制化信息分析服務內容。

樣品要求
土壤:10 g;糞便:3-5 g;血液:10 mL;污泥/沉積物:5-10 g;
DNA:總量 ≥ 1 μg、濃度 ≥ 20 ng/μL、1.8 < OD260/280 < 2.0。

項目周期
約50個工作日,視樣本類型而定。

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