蛋白標記定量分析

蛋白標記定量分析是指利用體外同位素標記(iTRAQ/TMT),對樣本進行標記并混合上機檢測,可同時比較2-11個樣品的蛋白質表達差異,分析不同處理、或不同生理/病理狀態下樣本中的蛋白表達差異變化,獲取蛋白質組分與豐度信息。蛋白標記定量技術具有技術成熟、應用廣泛、系統誤差較小、實驗及數據分析難度低等優點,因此目前已廣泛應用與蛋白定量分析。

應用領域
不同處理、不同生理/病理狀態下樣本中的蛋白質表達變化
蛋白調控網絡研究

技術路線

分析內容
1. 標準信息分析

1.1 數據產出統計
1.2 蛋白數據庫建立與Mascot軟件搜索
1.3 蛋白質鑒定
1.4 蛋白質功能注釋(GO功能、KEGG代謝通路、COG/KOG)
1.5 蛋白質定量
1.6 差異蛋白分析
1.7 差異蛋白GO/KEGG功能富集分析
1.8 多樣品間表達模式聚類分析(三個或三個以上樣品可提供)

2. 定制化信息分析
2.1 蛋白質組與轉錄組關聯分析
2.2 蛋白互作網絡分析

樣本要求
1. 新鮮動物組織:≥200mg
2. 信息植物組織:≥2g
3. 新鮮培養細胞:≥5*106個細胞每管,3管
4. 真菌、細菌:≥200mg
5. 血清、血漿:150μl * 4管
6. 體液樣本:尿液:5ml *4管(送樣前需1000g離心5min,棄去沉淀),其他體液(唾液、羊水、細胞培養上清液等)要求5ml以上。
7. 蛋白溶液:蛋白總量500μg以上

項目周期
標準流程的運轉周期約為55個工作日。

參考文獻
Rauniyar N, Yates J R. Isobaric Labeling-Based Relative Quantification in Shotgun Proteomics[J]. Journal of Proteome Research, 2014, 13(12): 5293-5309.
Chahrour O, Cobice D, Malone J, et al. Stable isotope labelling methods in mass spectrometry-based quantitative proteomics.[J]. Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 2015: 2-20.
Luo M, Zhao Y, Wang Y, et al. Comparative Proteomics of Contrasting Maize Genotypes Provides Insights into Salt-Stress Tolerance Mechanisms[J]. Journal of Proteome Research, 2018, 17(1): 141-153.

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